全真教和武当派同属道教，两者之间的关系是从属关系。在历史上，全真教又被称为全真道，是道教的一个流派，和全真教同级别的另一个道教流派是正一道。全真教在宋末元初于登州府宁海州成立，其开宗祖师是王嚞，人们对他的另一个名称“王重阳”更加熟悉，“重阳子”就是他的道号。全真教教义最突出的特点就是认为儒、道、释三教平等，三教核心皆为“道”。全真教的道士是需要出家的，不能婚娶。

而武当派则是全真教这一派别的，在元末明初于湖北一座山创立，其门派祖师叫张君宝。现代的武当山这个名字，也是由于山上的道门武当派才有这么一个名字。张君宝的道号为三丰，因此人们大多称他为“张三丰”。武当派在宗教方面属于全真教这一个流派，同样认为儒道释三教核心是“道”。武当派奉“真武大帝”为主神。从历史角度来讲，武当派具有浓厚的武术门派特色，更被誉为“内家之宗”，这与张三丰精于拳法、武术有很大关系。武当派最出名的拳法名为太极拳，讲究的是以柔克刚。

而在金庸老先生的武侠世界中，全真教和武当派是平等的武林门派关系，虽然他们都信奉道教，但两者在武林中都是大门派，功法精妙，门派内人才中出，全真教有所谓的“全真七子”，武当派也有“武当七侠”。但从金庸老先生的时间线来看，全真教的历史长于武当派，其创立时间早于武当派。